docs: reorganize into design, security, api, ops and dev; drop stale designs; refresh the diagrams [CI]

- Group docs by category with an index (docs/README.md); fix every link,
  code comment and the protocol conformance test that read docs/protocol.md.
- access.md and security.md rewritten to what is implemented: removed the
  unadopted member-proof chain, roles and recovery key that do not exist,
  the old implementation order and the budgets; gaps now carry a status.
- enrollment, deployment, api: the install flow is the static, hash-checked
  script with environment variables; no default admin.
- README and architecture: new topology and update-flow diagrams (operator
  passkey, CI signing, registry feed, auth and trust modules).

backend/src/MoShiro.Backend.Application/Auth/Capabilities.cs

@@ -2,7 +2,7 @@ namespace MoShiro.Backend.Application;
 
 /// <summary>
 /// 能力（capability）：一项具体的权限。端点声明自己需要哪一项，<see cref="Principal.Has"/> 是唯一的判断入口，
-/// 会话、API key 都走它。设计见 docs/access.md 第 2 节。
+/// 会话、API key 都走它。设计见 docs/security/access.md 第 3 节。
 /// </summary>
 public static class Capability
 {
@@ -38,7 +38,7 @@ public static class Capability
     public const string EventsRead = "events.read";
     public const string OpsMetrics = "ops.metrics";
 
-    // 预留：外部 webhook 回调和数据拉取（docs/access.md 5.4），目录里先存在，实现放后面
+    // 预留：外部 webhook 回调和数据拉取（docs/security/access.md 6.3），目录里先存在，实现放后面
     public const string DataExport = "data.export";
     public const string WebhooksRead = "webhooks.read";
     public const string WebhooksManage = "webhooks.manage";

backend/src/MoShiro.Backend.Application/Auth/PasskeyService.cs

@@ -22,7 +22,7 @@ public sealed record PasskeyAssertion(string CredentialId, string AuthenticatorD
 /// <summary>
 /// passkey 的注册与登录（WebAuthn，ES256，attestation 当 none）。挑战只在内存里，一次有效、5 分钟过期；
 /// 登录是「可发现凭证」：不需要先输用户名，凭证 id 找到用户。验证断言的纯函数在 <see cref="WebAuthnAssertion"/>（节点以后也用）。
-/// 设计见 docs/access.md 第 3 节。
+/// 设计见 docs/security/access.md 第 4 节。
 /// </summary>
 public sealed class PasskeyService
 {

backend/src/MoShiro.Backend.Application/Auth/TrustService.cs

@@ -20,7 +20,7 @@ public sealed record TrustState(bool Initialized, string? Genesis, int Version,
 /// <summary>
 /// 信任根的 Backend 一侧：保存操作员集合的链、给操作员出下一版的语句、验证他签回来的版本。
 /// Backend <b>不持有任何签名的能力</b>：每一版都要操作员的 passkey 触碰；节点从安装命令里固定的创世指纹出发自己验链，
-/// 所以 Backend 在这里的验证只是不收垃圾，不是信任的来源。设计见 docs/access.md 第 7 节。
+/// 所以 Backend 在这里的验证只是不收垃圾，不是信任的来源。设计见 docs/security/access.md 第 8 节。
 /// </summary>
 public sealed class TrustService : IOperatorTrustSource, IDisposable
 {

backend/src/MoShiro.Backend.Application/Auth/WebAuthnRegistration.cs

@@ -9,7 +9,7 @@ public sealed record RegisteredCredential(byte[] CredentialId, byte[] PublicKeyS
 
 /// <summary>
 /// 解析并校验 WebAuthn 注册（<c>navigator.credentials.create</c> 的结果）。只接受 ES256；attestation 一律当 <c>none</c> 处理：
-/// 不验设备证明，信任浏览器的实现（docs/access.md）。CBOR 解析只在 Backend 里，节点不带。
+/// 不验设备证明，信任浏览器的实现（docs/security/access.md）。CBOR 解析只在 Backend 里，节点不带。
 /// </summary>
 public static class WebAuthnRegistration
 {